真菌(fungus)，在自然界中分布广泛，种类亦是“人丁兴旺”。真菌是一类独立的真核生物群，比细菌大几倍-十几倍，具有真正的细胞核和细胞器，细胞核具有核膜、核仁，胞质内有完整的细胞器。细胞壁由几丁质或纤维素组成，不含叶绿素，不分化根、茎、叶。以腐生或寄生的方式生存，按有性或无性方式繁殖。无性繁殖是真菌的主要繁殖方式，主要形式有四种：芽生、裂殖、芽管、隔殖。真菌培养温度为37℃(酵母型和类酵母型)或25-28℃(丝状真菌)。最适合的酸碱度为pH4.0-6.0，也需要一定的湿度。目前已经命名的真菌至少有十万余种，其中绝大多数对人类有益，如发酵、酿酒、生产抗生素等，少数可引起人类及动植物的疾病。
与医学有关的真菌包括：①子囊菌门：具有子囊和子囊孢子，是真菌界中最大的一个门。有超过60%的已知真菌和大约85%的人类病原菌属于该门。常见菌属有引起原发感染的球孢子菌属、组织胞浆菌属;引起浅部感染的小孢子菌属、毛癣菌属;引起深部感染的假丝酵母属、曲霉属、镰刀菌属等。②担子菌门：具有担子和担孢子，包括食用菌蘑菇、灵芝等，以及机会致病性真菌，如隐球菌属、毛孢子菌属及马拉色菌属。③结合菌门：具有接合孢子，绝大多数为无隔多核菌丝体，有毛霉属、根霉属、根毛霉属、横梗霉属等。
按形态、结构分为单细胞真菌和多细胞真菌两类。单细胞真菌呈圆形或椭圆形，如酵母型和类酵母型真菌。
酵母型真菌不产生菌丝，由母细胞以芽生方式繁殖，其菌落与细菌的菌落相似;类酵母型真菌：母细胞以芽生方式繁殖，芽生孢子持续延长，但不断裂，不与母细胞脱离，产生藕芽状的细胞链，可伸入培养基内，称假菌丝。
多细胞真菌由菌丝和孢子两大基本结构组成。
菌丝：孢子生出嫩芽，称为芽管，芽管逐渐延长呈丝状，称为菌丝。菌丝在一定的间距形成横隔，称之为隔膜。隔膜将菌丝分成一连串的细胞，隔膜中央有孔，细胞质可自一个细胞流入另一个细胞。根据隔膜的消长，菌丝分为有隔菌丝与无隔菌丝。绝大部分致病性丝状真菌为有隔菌丝，致病性接合菌多为无隔菌丝。菌丝可长出许多分枝，交织成团，称菌丝体。伸入到培养基内者成为营养菌丝，露出于培养基表面者称为气生菌丝。部分气生菌丝可产生不同形状、大小和颜色的孢子，称为生殖菌丝。显微镜下菌丝的形态多样，如螺旋状、球拍状、结节状、鹿角状及破梳状等。
孢子：是由生殖菌丝产生的圆形或卵圆形结构，是真菌的生殖结构。
①无性孢子：是指不经过两性细胞的配合而产生的孢子。病原性真菌大多数产生无性孢子，可分为3种，即叶状孢子、分生孢子及孢子囊孢子。1、叶状孢子：由菌丝细胞直接形成的生殖孢子，有3种类型，芽生孢子、关节孢子、后膜孢子。2、分生孢子：是真菌常见的一种无性孢子，根据孢子大小和细胞数量可分为大分生孢子和小分生孢子。3、孢子囊孢子：由菌丝末端形成一种囊状结构即孢子囊，内有许多孢子，称为孢子囊孢子。孢子成熟后破囊散出，如毛霉。②有性孢子：有性孢子是由细胞间配合后产生的孢子，有接合孢子、子囊孢子及担孢子。有性孢子绝大多数为非致病性真菌所具有。
当致病性和机会性真菌侵入人体后，可引起真菌感染、真菌性超敏反应及真菌毒素中毒，某些真菌毒素还与致癌有关。同一种疾病可以由不同种真菌引起，一种真菌也可以引起不同类型的疾病。
致病性真菌包括球孢子菌、芽生菌、组织孢浆菌及马尔尼菲蓝状菌可引起原发性感染，但真菌感染多为继发性感染，由机会致病性真菌引起。特别是深部真菌感染多是由于各种诱因使机体免疫功能显著下降时发生。某些真菌，比如说白假丝酵母、烟曲霉中可产生高分子的强毒素或低分子毒素。这些毒素也在致病中起到一定作用。另外，真菌的粘附能力、对免疫系统功能的抑制及胞壁中的酶类也与致病性有一定关系。
真菌可以引发超敏反应，皮肤超敏反应主要表现有过敏性皮炎、湿疹、荨麻疹、瘙痒症等;呼吸道超敏反应主要是支气管哮喘及过敏性鼻炎。农民肺是由于吸入含真菌孢子的霉草灰尘而引起的，以呼吸困难、咳嗽、发热、不适、发绀等为特征的一种综合病症;消化道超敏反应多是由于食物中混入真菌所致。
另外，真菌毒素是真菌在其代谢过程中产生的，可以污染农作物、食物或饲料。人类多因食入而引起急性或者慢性中毒。真菌毒素中毒极易引起肝、肾、神经系统功能障碍以及造血机能损伤。另外，某些真菌的毒素与致癌有关，已经证明黄曲霉毒素有致癌作用，与肝癌的发生有关。除此之外，比如棒状曲霉、烟曲霉、黑曲霉、红曲霉、棕曲霉、文氏曲霉以及杂色曲霉等，也可以产生类似黄曲霉毒素的致癌物质。
目前尚无有效预防皮肤癣菌感染的方法，主要是注意清洁卫生、保持鞋袜干燥、透气性好，并避免直接或间接与病人接触。治疗上可局部使用特比奈芬喷剂或乳膏、酮康唑软膏、米康唑霜或克霉唑溶液，但较难根治，易复发。
对深部真菌病的防治主要应除去各种诱因，提高机体免疫力。尤其是细胞免疫功能低下的人群，或应用免疫抑制剂的病人，应注意防止并发真菌感染。常用的药物有唑类的氟康唑、伊曲康唑、伏立康唑及泊沙康唑，多烯类的两性霉素B，核苷类的5-氟胞嘧啶，棘白素类的卡泊芬净、米卡芬净等。氟康唑在临床上最常用，对白假丝酵母治疗效果较好。伊曲康唑、伏立康唑及泊沙康唑具有抗菌普广，尤其对曲霉疗效好，且毒副作用低的特点。两性霉素B由于副作用较大，且有效治疗剂量与中毒剂量接近，限制了其在临床的应用。棘白素类主要是应用于对其他药物不耐受或产生耐药的真菌感染者。
